Ingénieur en Bioinformatique H/F - CNRS

Description du Poste Les Missions Nous recrutons un·e ingénieure / ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nucleus RNA-seq générées à partir d'un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d'émergence au sein d'un embryon aviaire. L'Activité Les missions principales incluront :- Analyse et traitement des données single-nucleus. - Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients humaines publiques ou des nouvelles données issues de collaborations.- Application de méthodes bio-informatiques pour l'annotation cellulaire, l'identification de sous-populations, l'analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d'enrichissement en processus biologiques etc. - Collaboration étroite avec les biologistes de l'équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses.- Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité.- Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques. Votre Profil Compétences - Formation : Un Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, biostatistiques sera un atout. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nucleus est indispensable.- Compétences techniques :Expérience en programmation (R, Python) et en gestion de données. Maîtrise des outils d'analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA etc.).- Qualités personnelles : Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire. Votre Environnement de Travail - Contrat CDD de 6 mois renouvelable 6 moisL'Ingénieur H/F sera intégré à une équipe comprenant 1 ingénieur Bio-informaticien, et sera environné d'autres expertises en analyse de données. L'unité est située au coeur du campus de Lyon-Est à proximité des transports en commun. Rémunération et avantages Rémunération A partir de 2521€ brut selon expérience Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR5284-VALCAS-011 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche

• Gestion des données
• Python
• Programmation
• Autonomie
• Analyse de données
• Bio-informatique