Ingenieur d'Etudes en Biologie Computationelle H/F - CNRS

Description du Poste Les Missions Nous avons développé RAPToR, un logiciel permettant de déduire avec précision la progression de l'âge d'un échantillon à partir de son expression génique (Bulteau et Francesconi, Nature Methods 2022). RAPToR se limite toutefois actuellement à déduire la progression le long d'une seule trajectoire. Nous souhaitons donc désormais étendre RAPToR afin de déduire la progression le long de multiples trajectoires ramifiées, que l'on observe généralement dans les systèmes en cours de différenciation. Cela nous permettra de comprendre l'impact des perturbations génétiques ou non génétiques sur un système en développement au niveau de la cellule unique. L'Activité Vous serez amené(e) à :- Intégrer plusieurs ensembles de données transcriptomiques dans des atlas transcriptomiques de référence exhaustifs pour divers organismes modèles.- Analyser des données « -omiques » en appliquant des techniques avancées de modélisation multivariée et d'apprentissage automatique afin d'extraire des signatures d'expression génique interprétables.- Implémenter RAPToR multi-trajectoire dans un logiciel Votre Profil Compétences - Compétences en programmation dans l'un des langages suivants : R, Matlab ou Python.- Compétences en apprentissage automatique et en modélisation statistique avancée.- Compétences en gestion de bases de données.- Expérience avec un gestionnaire de pipelines (par exemple, Nextflow)- Expérience dans l'analyse de données « -omiques »- Bon niveau d'anglais Votre Environnement de Travail Le laboratoire Melis se consacre à la compréhension des mécanismes moléculaires fondamentaux des systèmes vivants.SPARK est une équipe pluridisciplinaire menant des axes de recherche variés. Ce poste s'inscrit dans le cadre d'un axe de recherche visant à développer et à utiliser des méthodes computationnelles pour extraire des informations phénotypiques interprétables et à plusieurs échelles à partir de données omiques à grande échelle, afin d'aborder des questions fondamentales sur la manière dont la régulation génique dans l'espace et dans le temps influe sur la variation phénotypique.Pour plus d'informations, veuillez contacter ****@****.** Contraintes et risques aucun Rémunération et avantages Rémunération a partir de 2521€ brut mensuel selon expérience Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR5284-MIRFRA-001 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) Expérience souhaitée 1 à 4 années À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche

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