Université Lyon 1 - Ingénieur en Imagerie Maldi et Spectrométrie de Masse H/F - Université Claude Bernard Lyon 1

UFR LYON EST - UFR Médecine Lyon Est Claude Bernard

La plateforme Spatial Multi-Omics de l'IHU EVEREST recrute un·e ingénieur·e spécialisé·e en imagerie MALDI et en spectrométrie de masse LC-HRMS, afin de renforcer ses activités analytiques autour de la caractérisation moléculaire spatiale et métabolomique d'échantillons biologiques en lien avec les maladies chroniques du foie.

La plateforme s'appuie notamment sur des technologies de spectrométrie de masse haute résolution, incluant un timsTOF fleX, permettant de combiner des approches d'imagerie MALDI, de MALDI-2, de LC-HRMS/MS et d'analyse multi-omique spatiale.

La personne recrutée participera aux activités de développement, d'acquisition, de traitement et d' interprétation de données en spectrométrie de masse.

Les missions incluront notamment :

- Préparation d'échantillons biologiques pour l'imagerie MALDI et les analyses LC-HRMS.
- Réalisation d'acquisitions en imagerie MALDI sur timsTOF fleX.
- Développement et optimisation de méthodes MALDI, MALDI imaging et LC-HRMS/MS.
- Participation aux analyses métabolomiques, lipidomiques et multi-omiques spatiales.
- Traitement des données issues de l'imagerie MALDI et de la LC-HRMS.
- Contribution à la mise en place de workflows analytiques robustes.
- Participation au contrôle qualité, à la maintenance de premier niveau et au suivi des performances
instrumentales.
- Interaction avec les équipes biologiques, cliniques et bioinformatiques impliquées dans les projets
de la plateforme.
- Contribution à la rédaction de protocoles, rapports techniques, figures et documents scientifiques.

Formation souhaitée :

- Master, diplôme d'ingénieur ou doctorat en chimie analytique, spectrométrie de masse, métabolomique, lipidomique, omiques spatiales, bioanalyse ou domaine proche.

Expérience souhaitée :

- Expérience en spectrométrie de masse haute résolution.
- Expérience en LC-HRMS et/ou LC-MS/MS.
- Une expérience en imagerie MALDI serait fortement appréciée.
- Une expérience sur instruments Bruker, notamment timsTOF fleX, serait un atout important.

Compétences attendues

- Bonne connaissance de la spectrométrie de masse appliquée aux échantillons biologiques.
- Maîtrise ou intérêt fort pour l'imagerie MALDI.
- Capacité à manipuler des échantillons biologiques complexes.
- Rigueur expérimentale et sens du contrôle qualité.
- Capacité à travailler en interaction avec des profils pluridisciplinaires.
- Autonomie, organisation, communication et esprit d'équipe.
- Des compétences en traitement de données sous Python, R, SCiLS Lab, MetaboScape,
DataAnalysis, MZmine ou outils équivalents seraient appréciées.

Environnement de travail

La personne recrutée intégrera une plateforme technologique dynamique

• Gestion des données
• Python
• Autonomie
• Contrôle qualité
• Spectrométrie de masse
• Flex
• Maintenance de premier niveau