Les missions du poste

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : EDISS - Interdisciplinaire Sciences-Santé Laboratoire de recherche : CARMEN - LABORATOIRE DE RECHERCHE EN CARDIOVASCULAIRE, MÉTABOLISME, DIABÉTOLOGIE ET NUTRITION Direction de la thèse : Julie Anne NAZARE ORCID 0000000335453264 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-03T23:59:59 La chirurgie bariatrique (CB) est le traitement le plus efficace pour obtenir une perte de poids durable, malgré une grande variabilité entre les individus (1). La chirurgie bariatrique a été associée à des modifications majeures de l'axe intestin-cerveau ayant un impact sur le comportement alimentaire, les préférences alimentaires, les perceptions sensorielles et le système de la récompense (2,3). Le microbiote intestinal est un acteur clé de l'axe intestin-cerveau et est profondément remodelé après une chirurgie. La variabilité individuelle dans les changements de préférences alimentaires et les altérations sensorielles signalées après chirurgie bariatrique, mais également en parallèle du microbiote intestinal, mérite d'être étudiée plus avant en lien avec la réussite de la perte de poids et son maintien après chirurgie. Le programme de recherche BARIA-gut-TASTE vise à comprendre l'interaction entre les changements du microbiote intestinal induits par la chirurgie bariatrique et le comportement alimentaire associés au succès et au maintien de la perte de poids.
Objectifs - Les objectifs scientifiques du projet de thèse sont les suivants:
Etudier si un régime alimentaire favorisant la diversité du microbiote intestinal après chirurgie bariatrique améliore le comportement alimentaire et le maintien de la perte de poids.
Caractériser les différents profils de répondeurs à la chirurgie bariatrique et étudier l'interrelation entre la modification du comportement alimentaire induite par la chirurgie, le microbiote intestinal et la perte de poids
Explorer les voies biologiques médiatrices potentielles et/ou les métabolites candidats afin d'identifier les signatures spécifiques de la relation entre le microbiote intestinal et les préférences alimentaires après chirurgie bariatrique.
Méthodes - « BARIA-gut-TASTE trial », qui fait partie d'un projet ANR multipartenaires, est un essai d'intervention prospectif randomisé à deux bras, en ouvert, auprès de femmes adultes en situation d'obésité candidates à une CB (sleeve ou Roux en Y by-pass). 60 sujets (18-65 ans, IMC>35 kg/m2) qui suivront un programme de perte de poids par chirurgie bariatrique seront randomisés dans l'un des deux groupes suivants : 1) conseils diététiques classiques pour le suivi post-CB, 2) conseils diététiques optimisés spécifiques pour favoriser la diversité du microbiote intestinal. Chaque sujet sera soumis à 3 journées d'investigation: 1 mois avant, 6 et 12 mois après CB, au cours desquels les préférences alimentaires, la récompense, le comportement et la consommation4 (questionnaires et buffet), la structure des repas (analyse vidéo), les profils sensoriels, ainsi que le poids et la composition corporelle, les paramètres métaboliques et inflammatoires, les hormones intestinales à jeun et post-prandiales seront évalués, et des analyses métabolomiques, volatolomiques et métagénomiques seront effectuées, et l'ensemble comparé de manière prospective. Pour définir les signatures de réponses différentielles, les méthodes comprendront une analyse exploratoire (par exemple, ACP, réseaux de corrélations). Des outils statistiques pour identifier de nouvelles associations (analyse multivariée, analyse de régression PLS, réseaux de neurones) et des outils bioinformatiques pour l'analyse multi-niveaux de données spécifiques seront utilisés en lien avec une équipe d'experts en statistiques.
Perspectives - D'une importance majeure pour la pratique clinique, les connaissances développées dans ce projet de thèse permettront d'adapter la prise en charge nutritionnelle des patients bénéficiant d'une chirurgie bariatrique vers des approches plus individuelles dans le cadre du concept de médecine de précision.

(1) Aron-Wisnewsky. Gut. 2019;68(1):7082 - (2) Guyot E. Obes Rev. 2021; 22(10):e13315 - (3) Martinou E. Int J Mol Sci. 2022;19;23(6):3339. 4 Ritsch. Appetite. 2025;206:107800.
Bariatric surgery is the most effective approach for achieving significant and sustained weight loss along with metabolic improvements. However, there is considerable variability between individuals in terms of weight loss and metabolic outcomes, even within the first year following surgery (1). Over the long term, some patients experience substantial weight regain, which can lead to a recurrence or worsening of metabolic issues after initial improvements. This can result in the need for revision surgeries, which are associated with higher risks of morbidity and reduces benefits.(2) Recent research highlights the role of the gut microbiota in weight regulation and metabolic dysfunction. The gut microbiota, a key player in the gut-brain axis, influences metabolism and reward-driven eating, and since bariatric surgery alters dietary patterns and behaviors, it may consequently reshape the microbiota's composition and function (3). Moreover, the individual variability in changing food preferences and reported sensory alterations following bariatric surgery, in parallel to differential alteration of gut microbiota merits further investigation regarding the weight loss success/maintenance after bariatric surgery (4). A previous study found out that bariatric surgery improves gut microbial gene richness, but it is only partially restored (as most patients remain below the cut-off of high diversity). Thus, this question whether pro-microbiota diversity (Pro-GM-div) nutritional intervention may be useful to consider prior to or post bariatric surgery to improve the gut microbiota ecosystem and bariatric surgery outcome (1). Consequently, it is essential to understand the interplay of bariatric surgery-induced changes of gut microbiota and of eating behavior associated with success and maintenance of post bariatric surgery-weight loss in order to lead the development of personalized therapeutic approaches and improve post-bariatric surgery management in patients with poor bariatric surgery-response.

Le profil recherché

- Master 2 recherche ou diplôme equivalent
- Motivation, rigueur, curiosité
- Compétences solides en physiologie et nutrition humaine, maîtrise des biostatistiques et des analyses multivariées, intérêt pour les données complexes issues d'approches métagénomiques ou métabolomiques.
- Anglais lu, écrit, parlé

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