Thèse Définition des Mécanismes Moléculaires Sous-Jacents au Traffic Cellulaire d'Un Facteur de Répression de la Transcription Application aux Traitements Anti-Cancer H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : CanBioS - Cancérologie, Biologie, Santé de Lyon Laboratoire de recherche : CRCL - CENTRE DE RECHERCHE EN CANCÉROLOGIE DE LYON Direction de la thèse : Jean-Jacques DIAZ ORCID 0000000279144319 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59 L'externalisation des protéines est une caractéristique émergente du cancer, correspondant à la relocalisation aberrante de protéines strictement intracellulaires dans les cellules saines vers la surface cellulaire dans des contextes tumoraux. Ces protéines exposées constituent une classe de cibles spécifiques aux tumeurs encore peu explorée. Le projet se concentre sur un corépresseur transcriptionnel normalement localisé dans le noyau, que nous avons identifié sous
une forme externalisée à la surface des cellules cancéreuses.L'objectif de la thèse est : i) d'identifier les déterminants structuraux de ce corépresseur responsables de son traffic et de ses différentes fonctions ii) de développer un anticorps thérapeutique ciblant cette protéine. Des approches bioinformatiques couplées à des constructions de protéines recombinantes suivies d'analyses de biologie cellulaire permettront de déterminer la séquence minimale nécessaire et suffisante au traffic cellulaire et à ses différentes fonctions. Une approche de recherche translationnelle sera développée pour élaborer un anticorps ciblant ce co-répresseur pour déterminer s'il constitue une cible thérapeutique anti-cancer.
Le corépresseur transcriptionnel identifié et qui fait l'objet du projet de thèse est présent à la surface des cellules cancéreuses, et tout comme d'autres protéines nucléaires la nucléoline (NCL), hnRNP-U, YBX1, DDX211 et NPM12 est capable de faire la navette entre surface cellulaire et compartiment intracellulaire.
Cependant, les mécanismes et les domaines protéiques impliqués dans ce processus restent à déterminer.
La modélisation in silico permettra de déterminer s'il existe, au sein de la protéine, une séquence d'acides aminés capable de traverser spontanément les membranes bicouches lipidiques. Des méthodes issues de la biologie cellulaire et de la biophysique seront utilisées pour élucider les mécanismes de transport, soit à partir de lignées cellulaires cancéreuses, soit à l'aide de modèles in vitro reproduisant les membranes plasmiques.

Profil
Le candidat devra être méticuleux et avoir le sens de l'organisation et du travail en équipe. Il devra savoir faire preuve de rigueur, d'autonomie, d'esprit d'initiative et de maturité.
Compétences
- Techniques de biologie cellulaire (culture cellulaire) et biologie moléculaire (extraction d'ADN et ARN, PCR, qRT-PCR, clonage, transfection, western-blot, immunofluorescence, microscopie, cytométrie en flux et analyse d'image).
- Technique d'immunohistochimie