Les missions du poste

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : CanBioS - Cancérologie, Biologie, Santé de Lyon Laboratoire de recherche : CRCL - CENTRE DE RECHERCHE EN CANCÉROLOGIE DE LYON Direction de la thèse : Frederic CATEZ ORCID 0000000182559091 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-30T23:59:59 Les ribosomes, longtemps considérés comme des entités passives, sont désormais reconnus comme des régulateurs de la traduction via des variations de leur composition. En particulier, les modifications chimiques des ARN ribosomiques (ARNr) peuvent moduler la traduction de manière spécifique à certains ARNm. Toutefois, leur rôle précis dans l'établissement des programmes traductionnels reste à élucider. Nous avons montré que la 2-O-méthylation (2-O-Me), la modification la plus abondante des ARNr, est altérée dans le cancer du sein et contrôle sélectivement la traduction d'ARNm oncogéniques.
Les métastases, principale cause de mortalité liée au cancer, repose sur la capacité des cellules tumorales à franchir les barrières endothéliales, un processus encore mal compris. Nous avons montré que les traitements chimiothérapeutiques affaiblissent la barrière endothéliale, facilitant ainsi l'entrée des cellules tumorales dans les vaisseaux lymphatiques. Ces traitements modifient également les profils de 2-O-Me à la fois dans les cellules tumorales mammaires et dans les cellules endothéliales lymphatiques.
Nous faisons l'hypothèse que la chimiothérapie reprogramme la traduction via des modifications des ARNr, conduisant à l'émergence de phénotypes cellulaires pro-métastatiques. Mon projet de thèse vise à décrypter ces mécanismes en combinant une cartographie précise et une modulation ciblée des modifications des ARNr avec des approches omiques du translatome et du sécrétome, ainsi que l'analyse du comportement cellulaire dans les cellules tumorales et endothéliales.
Ce travail permettra de proposer un nouveau cadre mécanistique de la régulation de l'expression génique impliquée dans la communication entre tumeur et endothélium et dans le processus métastatique, et offrira de nouvelles opportunités d'exploitation de l'épitranscriptome des ARNr comme biomarqueur et comme cible thérapeutique.
Au cours de la dernière décennie a émergé le concept que les cellules produisent des ribosomes de composition différente, afin de moduler la traduction de certains ARNm. L'identification d'altérations des ribosomes dans divers cancers par notre équipe pose l'hypothèse d'une contribution de ces ribosomes dans l'expression génique tumorale et l'établissement du phénotype tumoral.

Le profil recherché

Master en biologie, biochimie ou biologie moléculaire (ou diplôme équivalent d'une école d'ingénieurs).
- Haute motivation et excellentes compétences en communication.
- Passion pour la compréhension des mécanismes moléculaires impliqués dans la vie. Des compétences en biologie cellulaire ou en biochimie seront essentielles.
- Des connaissances en biologie moléculaire, en traduction in vitro et en imagerie cellulaire seraient un plus.

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