Thèse Plasticité des Cellules Tumorales et Interactions avec le Microenvironnement Tumoral dans la Progression Métastatique du Mélanome H/F - 69

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1
École doctorale : CanBioS - Cancérologie, Biologie, Santé de Lyon
Laboratoire de recherche : CRCL - CENTRE DE RECHERCHE EN CANCÉROLOGIE DE LYON
Direction de la thèse : JULIE CARAMEL ORCID 000000028883918X
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Afin de caractériser l'hétérogénéité des cellules tumorales et du microenvironnement et d'identifier les principales caractéristiques cellulaires et moléculaires temporelles favorisant la progression métastatique, nous avons processé une cohorte de lésions cutanées primitives et métastatiques appariées provenant de l'unité clinique de dermato-oncologie dirigée par le Pr Stéphane DALLE (Hôpital Lyon Sud) par snRNAseq. Une annotation détaillée de l'hétérogénéité des états cellulaires du mélanome a permis de définir différents états allant du mélanocytaire au mésenchymateux, à travers un continuum d'états. Des analyses différentielles ont mis en évidence un enrichissement des états cellulaires tout au long de la progression métastatique.
Nous avons également mis en évidence des changements dans la composition du microenvironnement tumoral, notamment dans les sous-ensembles immunitaires et les fibroblastes associés au cancer (CAF). Afin d'étudier l'interaction entre les cellules tumorales et les cellules du microenvironnement tumoral, des analyses de communication intercellulaire ont été réalisées, permettant d'identifier les interactions ligand-récepteur entre les états des cellules de mélanome et les sous-ensembles de cellules immunitaires et de CAF, dont l'expression change au cours de la progression tumorale, du stade primaire au stade métastatique.
L'objectif de la thèse est d'étudier le rôle des candidats identifiés dans la régulation de la transition des états des cellules de mélanome par gain ou perte de fonction dans des modèles in vitro. Les interactions candidates régulant l'interaction des cellules de mélanome avec le TME seront évaluées fonctionnellement dans des modèles murins de mélanome. La pertinence des voies identifiées dans les échantillons humains sera ensuite examinée à l'aide d'analyses spatiales multiplexes permettant de disséquer l'hétérogénéité intratumorale en relation avec le microenvironnement immunitaire.

La plasticité phénotypique du mélanome cutané est une source majeure d'hétérogénéité intratumorale (ITH) qui influe l'évolution de la maladie chez les patients au cours de la progression tumorale. L'avènement de la transcriptomique unicellulaire a permis de mieux comprendre l'ITH des échantillons de mélanomes métastatiques humains et son impact sur les résultats thérapeutiques des patients. Cependant, la manière dont les transitions précoces de l'état des cellules tumorales et l'ITH apparaissent, et dans quelle mesure elles alimentent la progression précoce du mélanome, restent difficiles à cerner. De plus, le microenvironnement tumoral (TME) est de plus en plus reconnu comme un régulateur essentiel de la progression métastatique, mais la contribution de la communication intercellulaire au sein de l'écosystème de la tumeur primaire reste incertaine.